Onsen-opplevelsen i Tokyo handler om å kombinere byens puls med tradisjonell japansk badkultur. Selv om hovedstaden ikke har vulkanske kilder innenfor bygrensen, har flere hoteller løst dette med kunstige varmekilder og sirkulerende mineralvann. Du kan for eksempel ta et bad på Onsen Ryokan Yuen Shinjuku i Shinjuku, hvor det finnes både innendørs og utendørs varmkilder, eller velge Dormy Inn Akihabara som har et takbadekar med utsikt over Akihabara. Uansett hvor du bor, kan du forvente å finne fasiliteter som varmkilder, åpent luftbad, dampbadstue og ofte en restaurant som serverer lokale spesialiteter. Prisene varierer fra rundt 1 500 kroner per natt for et standardrom, og du bør beregne mer for de sentrale strøkene som Shinjuku og Akihabara.
For reisende som ønsker å bo nær flyplassen, er Villa Fontaine Grand Haneda Airport et godt valg. Dette hotellet ligger direkte forbundet med Terminal 3 og har både åpent varmkildesbad, steinspa og badstue - perfekt for en avslappende start eller slutt på reisen. Hvis du foretrekker en sentral beliggenhet med litt luksus, ligger The Prince Park Tower Tokyo ved Tokyo Tower og tilbyr rom med utsikt over byen og parken, i tillegg til et varmkildespa og innendørsbasseng. De fleste hotellene har døgnåpen resepsjon, wi-fi og flere spisesteder. Husk at noen fasiliteter, som varmkildebad, kan være separat for menn og kvinner - ikke uvanlig i Japan. Ta med eget håndkle eller undersøk om hotellet tilbyr utlån, og vær oppmerksom på at mange onsen krever at du vasker kroppen før du går i badekaret.